在CRISPR-CAS9這個基因編輯的新星冉冉升起的時候，20年前的希望RNAi技術，終於有第一個產品Onapattro (Patisiran) 在2018年8月被USFDA批准上市了。
重磅！20年後，首款RNAi療法終見曙光
[新藥介紹] 基因新藥Collategen (Beperminogene Perplasmid)
Posted: 26 二月, 2019 by Nabo Ludo in New Drug information這次想討論日本PMDA在最近(2019FEB20)給予有條件上市許可的第一個基因藥物-Collategene (Beperminogene Perplasmid)，主要適應症是危急性肢體缺血(critical limb ischemia; CLI)。作用機轉是藉由Hepatoyte Growth Factor促進血管新生 (Therapeutic Angiognesis)，減少因周邊動脈疾病(peripheral artery disease) 造成的CLI。
1．基因治療藥在日本首次獲批 最早5月問世
https://zh.cn.nikkei.com/industry/scienceatechnology/34410-2019-02-21-09-10-35.html
2．Japan approves 2 gene treatments in bid to catch up
https://asia.nikkei.com/Business/Science/Japan-approves-2-gene-treatments-in-bid-to-catch-up
今年第28屆的Ig Nobel Prize年度主題是「HEART」。剛好和今天要討論的臨床試驗有相關。
https://www.improbable.com/ig/2018/images/2018IgPoster.pdf
APPLE在2018.09.11收到FDA的上市許可[1]，09.12就在秋季發表會上演示了APPLE WATCH自帶ECG監測的APP。但FDA的說明文件上載明ECG APP可以認為屬於非處方使用(over-the-counter, OTC)，但22歲以下的使用者，以及已經診斷為心房纖維顫動（Atrial fibrillation）的病人並不適用。
這次來討論NEJM在最近(2018AUG30)發佈的治療多發性硬化症(Multiple Sclerosis, MS)的新藥Ibudilast 的II期試驗。(Phase 2 Trial of Ibudilast in Progressive Multiple Sclerosis)
下面的連結裡有新聞影片介紹與收案條件：
1．克里夫蘭醫學中心(Cleveland clinic): New Drug Shows Unprecedented Findings in Progressive Multiple Sclerosis
2．Breakthrough Trial Shows Asthma Drug Can Dramatically Slow Multiple Sclerosis Progression
3．Safety, Tolerability and Activity Study of Ibudilast in Subjects With Progressive Multiple Sclerosis
前一篇<[SAS] Difference-in-Difference (part 1)>提到Predicted Value以及Bootstrap, 這邊簡單分享SAS語法.
在醫藥公衛相關研究, 習慣是將迴歸分析止於迴歸係數的討論 (例如: 係數有沒有顯著, A是B的幾倍, etc.). 然而, 迴歸模型除了幫助我們了解自變項與依變項之間的關係外, 迴歸式本身的用途, 就是拿來做預測~ 也就是說, 我們可以將每個subject的data套進該迴歸式, 去預測每個subject的Y.
從SAS output, 我們可得到截距項以及各個自變項的係數. 接下來, 如果是要將這個迴歸式套用至另一份資料, 研究者可以直接輸出這些係數去使用; 那如果只是想知道原dataset中, 每筆資料的預測值呢? 接續上篇的例子, 我們只要在語法中多加一行 (output out = XXX p = YYY;) 就可以得到它了:
proc genmod data = DRG.ANAL1 descending; class MATCH_ID TIME INTERVENTION Male AgeGroup CCIGroup/param = ref ref = first; model Readmin30 = TIME INTERVENTION TIME*INTERVENTION Male AgeGroup CCIGroup/dist = bin link = logit; output out = preds p = plogit; repeated subject = MATCH_ID/type = exch; run;
先前有簡介過期中分析相關的試驗設計:
這邊簡單分享SAS codes, 以及不同sequential methods下, 所得到的期中/期末分析alpha值. 以Power Family (eg. ERRFUNCPOW(rho=2)) 這個method為例, nstages表示總共的分析次數 (eg. 一次期中, 期末), info裡面則輸入這兩次分析的累積資訊 (eg. 收案比例, 事件發生比例).
[註] 關於rho這個參數, 可參考SAS的說明. 當rho = 1, 會接近Pocock method的結果; 當rho = 3, 會接近O’Brien-Fleming method的結果.
proc seqdesign errspend boundaryscale=pvalue; TwoSidedErrorSpending: design method=ERRFUNCPOW(rho=2) nstages=2 alpha=0.05 beta=0.2 alt=twosided stop=reject info=cum(0.6 1); run;
來介紹日前新聞網中最HOT新藥，HERNICORE，日本PMDA批准治療椎間盤突出的針劑。HERNICORE在2018年3月23通過PMDA審查，並預計8月在日本上市。HERNICORE的作用機轉在各新聞網寫得淺顯易懂，可以直接連結到新聞網去看。
蘋果日報：一針治好椎間盤突出 日本新藥下月上市 療程僅30分鐘
利用SAS分析出統計結果後，接下來就是報告的產出。產出的報告可以有許多種樣式，如PDF、EXCEL、word (RTF)，HTML…等等。最常用的就是 PDF 還有 word (RTF)。
要產出精緻的樣式和風格時，通常我們都會用 proc report 來 output 這些表格。以下為利用 proc report 來產出 PDF 的用法。非常容易就可以產出簡單的統計報表。
options nodate nonumber; ods printer pdf file = "XXX.pdf" ; proc report data = dataset nowd contents = "XXX"; title1 ; title3 "XXX"; run; ods printer pdf close;
然而，有時候產出的報告要讓審閱者方便閱讀，會在排版上做一些修整。這時候單是靠 proc report 是不夠的。由於每一次 proc report 執行後在 PDF 格式下的 bookmark 都會是獨立的，若要把一些相關的 report 在 bookmark 歸類在同一個項目底下時就無法單單只是靠 proc report。這時就是 ods document 出馬的時候。
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